Ob das in der 1.0 immer noch so ist weiss ich nicht, noch keine Zeit gehabt ...
Aber generell ist es so, dass Windows ja meistens zwei Einträge pro Datei bzw. Verzeichnis anlegt. Einen Eintrag gibt es nur wenn weniger als 8.3 Zeichen und keine gemischte Gross/Kleinschreibung verwendet werden. Aber so ganz reproduziertbar war das bei mir leider nie
Im Readme des mmc64 update steht auch irgendwo dass man da aufpassen muss ...