Nichts anderes, als daß das funktioniert, hätte ich erwartet.
Aber wie Du schon richtig bemerkst: 2 aktive Host-Adapter an einem SCSI Bus gehen natürlich nicht, daher nicht beide Rechner gleichzeitig laufen lassen. Dann würde am SCSI-Bus sicher garnichts mehr funktionieren.
Hast Du am Amiga-Ende einen aktiven Terminator?
Wenn da nur ein passiver ist, könnte das eine wackelige Konstruktion sein.