Eine nackte WB3.1? Dann ist das wirklich komisch, denn gerade dann sollte es funktionieren.
Du hast also ein Piktogramm aus einem Unterordner markiert, bist per Rechte-Maustaste-Menü auf "Piktogramm" gegangen und dort auf "auslagern" ?
Wurde das Piktogramm draußen auf der Workbench dann angezeigt?
Kann es vielleicht sein, dass beim Neustart einfach nur ein paar Piktogramme verschoben worden sind und Du deswegen dein Ausgelagertes nicht mehr sehen kannst?
Vielleicht hilft bei Dir ja die Funktion "fixieren"... Wobei es auch ohne funktionieren muss... *verwirrt*