Wenn Du etwas wartest bekommst Du, natürlich für mehr Geld, die neue ACA 1230/56. Mit der dürfte OS3.9 richtig ordentlich laufen, soll auf jeden Fall alle bisherigen 030er turbokarten in den schatten stellen...und Du hast die doppelte Menge RAM.
Nenn mich größenwahnsinnig aber ich kaufe meine Erweiterungen nach dem Prinzip: Viel hilft viel 
Du brauchst mit den ACA Karten nicht unbedingt Kick 3.1, da Du es ja quasi "nachladen" kannst und es dann im RAM schneller arbeitet als direkt aus dem ROM. Aber beim Starten muss ja erst mal die 3.1er ROM Datei geladen werden, zumindest hier dauert es dann, wenn auch nur unwesentlich, länger.
Um Deine Frage zu beantworten: Ich würde mir ein Kick 3.1 ROM kaufen. Ich remappe ein ROM immer nur "von oben nach unten", soll heissen: 3.1 ist fest eingebaut und wenn ich ein 2.04 oder 1.3 haben möchte dann wird eben das nachgeladen aber das ROM mit dem ich am meisten zu tun habe (nämlich 3.1) ist fest eingebaut.