Vermutlich weil die wenigen Spiele, die überhaupt einen zweiten Button benutzt haben, die entsprechenden Tatsachen geschaffen haben.
Möglich, ja. Während es am Amiga ja recht viele Spiele gibt, die Feuer-2 für irgendeine Zusatzfunktion nutzen (etwa etliche Shooter), kann man die C64 Spiele, die den zweiten Button des "Cheetah Annihilator" Joysticks benutzen, mit zwei Händen abzählen:
https://www.c64-wiki.de/wiki/Cheetah_Annihilator
Wäre es schon bei C64 Spielen damals sowas wie ein Standard gewesen, dass sie eine Funktion auf Feuer-2 haben, dann wäre es, so vermute ich, wahrscheinlich später dann auch genau so auf den Amiga mit übernommen worden von der Beschaltung her. Da das nicht der Fall war, fingen die dann damit nochmal anders an. Also, schätze ich jetzt mal, daß es so war.