Ich habe einen echten Amiga 600 und den MISTer, dessen Minimig übrigens schon erweitert und verbessert wurde zum Original und ich merke überhaupt keinen Unterschied. Alles läuft wie man es kennt, alle Floppies (.adf) booten und funktionieren einwandfrei, hab auch meine A600 HDD mit WINUAE geklont und konnte sie direkt aufm MISTer starten, Workbench, WHDLoad, läuft alles wie auf der Hardware.
Nur AGA ist nicht so gut, da gibt es Probleme. OCS/ECS aber meiner Meinung nach 100%, konnte zumindest bisher nichts finden.